Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pggt1bQ8BUY9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pggt1bQ8BUY9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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