Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nup54Q8BTS4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nup54Q8BTS4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms