Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PcgF3Q8BTQ0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcgF3Q8BTQ0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms