Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfascQ810U3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NfascQ810U3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms