Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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NanogQ80Z64 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NanogQ80Z64 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms