Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ0

Aldh3b1, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b1Q80VQ0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aldh3b1Q80VQ0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aldh3b1Q80VQ0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aldh3b1Q80VQ0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aldh3b1Q80VQ0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aldh3b1Q80VQ0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aldh3b1Q80VQ0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aldh3b1Q80VQ0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aldh3b1Q80VQ0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Aldh3b1Q80VQ0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aldh3b1Q80VQ0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aldh3b1Q80VQ0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Aldh3b1Q80VQ0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Aldh3b1Q80VQ0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Aldh3b1Q80VQ0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Aldh3b1Q80VQ0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Aldh3b1Q80VQ0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Aldh3b1Q80VQ0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Aldh3b1Q80VQ0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Aldh3b1Q80VQ0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Aldh3b1Q80VQ0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Aldh3b1Q80VQ0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Aldh3b1Q80VQ0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Aldh3b1Q80VQ0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Aldh3b1Q80VQ0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Aldh3b1Q80VQ0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Aldh3b1Q80VQ0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Aldh3b1Q80VQ0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Aldh3b1Q80VQ0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms