Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Avl9Q80U56 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms