Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sgo2Q7TSY8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sgo2Q7TSY8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sgo2Q7TSY8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Sgo2Q7TSY8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sgo2Q7TSY8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sgo2Q7TSY8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sgo2Q7TSY8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sgo2Q7TSY8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sgo2Q7TSY8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sgo2Q7TSY8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sgo2Q7TSY8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sgo2Q7TSY8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sgo2Q7TSY8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sgo2Q7TSY8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sgo2Q7TSY8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sgo2Q7TSY8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms