Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lamp3Q7TST5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms