Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms