Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ckap2lQ7TS74 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ckap2lQ7TS74 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms