Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnf139Q7TMV1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rnf139Q7TMV1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rnf139Q7TMV1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rnf139Q7TMV1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms