Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vma21Q78T54 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vma21Q78T54 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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