Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim12Q78RX3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim12Q78RX3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms