Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casc1Q6TDU8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casc1Q6TDU8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms