Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ7

Cd300lf, CMRF35-like molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lfQ6SJQ7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd300lfQ6SJQ7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd300lfQ6SJQ7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd300lfQ6SJQ7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd300lfQ6SJQ7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd300lfQ6SJQ7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd300lfQ6SJQ7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd300lfQ6SJQ7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd300lfQ6SJQ7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd300lfQ6SJQ7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd300lfQ6SJQ7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd300lfQ6SJQ7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cd300lfQ6SJQ7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms