Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GcsamQ6RFH4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms