Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nudcd1Q6PIP5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nudcd1Q6PIP5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms