Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc85bQ6PDY0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc85bQ6PDY0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc85bQ6PDY0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc85bQ6PDY0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc85bQ6PDY0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc85bQ6PDY0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc85bQ6PDY0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc85bQ6PDY0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc85bQ6PDY0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc85bQ6PDY0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc85bQ6PDY0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc85bQ6PDY0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc85bQ6PDY0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc85bQ6PDY0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc85bQ6PDY0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc85bQ6PDY0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc85bQ6PDY0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc85bQ6PDY0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc85bQ6PDY0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc85bQ6PDY0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc85bQ6PDY0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc85bQ6PDY0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc85bQ6PDY0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc85bQ6PDY0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc85bQ6PDY0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc85bQ6PDY0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms