Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Szrd1Q6NXN1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Szrd1Q6NXN1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms