Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg16l2Q6KAU8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atg16l2Q6KAU8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atg16l2Q6KAU8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms