Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CltbQ6IRU5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CltbQ6IRU5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms