Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE28

Gm5416, Predicted gene 5416, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5416Q6IE28 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5416Q6IE28 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5416Q6IE28 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5416Q6IE28 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm5416Q6IE28 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
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Gm5416Q6IE28 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Gm5416Q6IE28 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm5416Q6IE28 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Gm5416Q6IE28 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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Gm5416Q6IE28 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Gm5416Q6IE28 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Gm5416Q6IE28 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Gm5416Q6IE28 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Gm5416Q6IE28 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5416Q6IE28 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5416Q6IE28 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Gm5416Q6IE28 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Gm5416Q6IE28 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5416Q6IE28 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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