Protein–RNA interactions for Protein: Q6A065

Cep170, Centrosomal protein of 170 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170Q6A065 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cep170Q6A065 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cep170Q6A065 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cep170Q6A065 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Cep170Q6A065 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cep170Q6A065 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cep170Q6A065 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cep170Q6A065 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cep170Q6A065 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cep170Q6A065 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cep170Q6A065 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Cep170Q6A065 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cep170Q6A065 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cep170Q6A065 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cep170Q6A065 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cep170Q6A065 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cep170Q6A065 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cep170Q6A065 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cep170Q6A065 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cep170Q6A065 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cep170Q6A065 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cep170Q6A065 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cep170Q6A065 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cep170Q6A065 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cep170Q6A065 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cep170Q6A065 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cep170Q6A065 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cep170Q6A065 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cep170Q6A065 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cep170Q6A065 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cep170Q6A065 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cep170Q6A065 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cep170Q6A065 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cep170Q6A065 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cep170Q6A065 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cep170Q6A065 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cep170Q6A065 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Cep170Q6A065 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cep170Q6A065 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Cep170Q6A065 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cep170Q6A065 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cep170Q6A065 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cep170Q6A065 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Cep170Q6A065 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cep170Q6A065 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cep170Q6A065 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Cep170Q6A065 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cep170Q6A065 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cep170Q6A065 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms