Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Jmjd1cQ69ZK6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms