Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VclQ64727 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VclQ64727 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VclQ64727 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VclQ64727 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
VclQ64727 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
VclQ64727 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VclQ64727 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VclQ64727 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VclQ64727 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VclQ64727 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VclQ64727 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VclQ64727 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VclQ64727 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VclQ64727 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VclQ64727 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VclQ64727 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VclQ64727 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VclQ64727 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VclQ64727 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VclQ64727 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VclQ64727 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VclQ64727 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VclQ64727 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VclQ64727 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VclQ64727 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VclQ64727 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VclQ64727 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VclQ64727 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VclQ64727 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VclQ64727 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VclQ64727 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VclQ64727 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VclQ64727 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VclQ64727 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VclQ64727 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VclQ64727 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VclQ64727 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VclQ64727 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VclQ64727 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VclQ64727 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VclQ64727 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VclQ64727 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VclQ64727 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
VclQ64727 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
VclQ64727 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VclQ64727 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VclQ64727 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VclQ64727 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VclQ64727 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
VclQ64727 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VclQ64727 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VclQ64727 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VclQ64727 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VclQ64727 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VclQ64727 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VclQ64727 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VclQ64727 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VclQ64727 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
VclQ64727 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VclQ64727 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VclQ64727 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VclQ64727 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VclQ64727 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VclQ64727 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VclQ64727 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VclQ64727 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VclQ64727 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VclQ64727 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VclQ64727 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VclQ64727 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VclQ64727 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VclQ64727 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VclQ64727 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VclQ64727 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VclQ64727 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VclQ64727 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VclQ64727 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VclQ64727 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VclQ64727 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
VclQ64727 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
VclQ64727 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
VclQ64727 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VclQ64727 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VclQ64727 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VclQ64727 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VclQ64727 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VclQ64727 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VclQ64727 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VclQ64727 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VclQ64727 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VclQ64727 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VclQ64727 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VclQ64727 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VclQ64727 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VclQ64727 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VclQ64727 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VclQ64727 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VclQ64727 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VclQ64727 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms