Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt12Q64291 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt12Q64291 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt12Q64291 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt12Q64291 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt12Q64291 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt12Q64291 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt12Q64291 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt12Q64291 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt12Q64291 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt12Q64291 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt12Q64291 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt12Q64291 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt12Q64291 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt12Q64291 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt12Q64291 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt12Q64291 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt12Q64291 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt12Q64291 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt12Q64291 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt12Q64291 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt12Q64291 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt12Q64291 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt12Q64291 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms