Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Zfp248Q640N4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Zfp248Q640N4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Zfp248Q640N4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Zfp248Q640N4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Zfp248Q640N4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Zfp248Q640N4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Zfp248Q640N4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Zfp248Q640N4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Zfp248Q640N4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Zfp248Q640N4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Zfp248Q640N4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Zfp248Q640N4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Zfp248Q640N4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Zfp248Q640N4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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