Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Vat1Q62465 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vat1Q62465 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms