Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nptx1Q62443 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms