Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tff3Q62395 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tff3Q62395 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tff3Q62395 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tff3Q62395 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tff3Q62395 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tff3Q62395 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tff3Q62395 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tff3Q62395 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tff3Q62395 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tff3Q62395 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tff3Q62395 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tff3Q62395 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tff3Q62395 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tff3Q62395 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tff3Q62395 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tff3Q62395 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tff3Q62395 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tff3Q62395 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tff3Q62395 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tff3Q62395 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tff3Q62395 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tff3Q62395 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tff3Q62395 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tff3Q62395 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tff3Q62395 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tff3Q62395 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tff3Q62395 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tff3Q62395 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tff3Q62395 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tff3Q62395 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tff3Q62395 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tff3Q62395 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tff3Q62395 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tff3Q62395 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tff3Q62395 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tff3Q62395 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tff3Q62395 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tff3Q62395 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tff3Q62395 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tff3Q62395 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tff3Q62395 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms