Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Sycp1Q62209 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sycp1Q62209 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms