Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm38Q62176 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm38Q62176 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm38Q62176 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm38Q62176 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm38Q62176 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm38Q62176 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbm38Q62176 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rbm38Q62176 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rbm38Q62176 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbm38Q62176 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbm38Q62176 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbm38Q62176 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbm38Q62176 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbm38Q62176 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbm38Q62176 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbm38Q62176 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbm38Q62176 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbm38Q62176 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbm38Q62176 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbm38Q62176 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbm38Q62176 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbm38Q62176 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm38Q62176 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm38Q62176 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm38Q62176 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm38Q62176 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm38Q62176 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm38Q62176 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm38Q62176 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbm38Q62176 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms