Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sin3bQ62141 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sin3bQ62141 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms