Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctr9Q62018 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctr9Q62018 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctr9Q62018 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ctr9Q62018 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctr9Q62018 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctr9Q62018 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctr9Q62018 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctr9Q62018 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctr9Q62018 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctr9Q62018 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctr9Q62018 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctr9Q62018 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctr9Q62018 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctr9Q62018 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctr9Q62018 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctr9Q62018 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctr9Q62018 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctr9Q62018 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctr9Q62018 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctr9Q62018 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctr9Q62018 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctr9Q62018 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctr9Q62018 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctr9Q62018 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctr9Q62018 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctr9Q62018 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctr9Q62018 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctr9Q62018 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms