Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prg2Q61878 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prg2Q61878 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prg2Q61878 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms