Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BcanQ61361 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BcanQ61361 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BcanQ61361 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BcanQ61361 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BcanQ61361 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BcanQ61361 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BcanQ61361 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BcanQ61361 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
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