Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ctnna2Q61301 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnna2Q61301 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnna2Q61301 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnna2Q61301 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnna2Q61301 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnna2Q61301 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnna2Q61301 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnna2Q61301 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnna2Q61301 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnna2Q61301 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnna2Q61301 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnna2Q61301 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna2Q61301 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna2Q61301 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna2Q61301 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna2Q61301 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna2Q61301 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna2Q61301 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna2Q61301 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna2Q61301 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna2Q61301 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna2Q61301 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna2Q61301 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna2Q61301 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna2Q61301 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna2Q61301 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna2Q61301 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna2Q61301 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna2Q61301 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna2Q61301 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna2Q61301 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna2Q61301 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna2Q61301 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna2Q61301 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna2Q61301 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna2Q61301 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna2Q61301 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna2Q61301 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna2Q61301 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna2Q61301 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctnna2Q61301 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctnna2Q61301 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms