Protein–RNA interactions for Protein: Q61189

Clns1a, Methylosome subunit pICln, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clns1aQ61189 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clns1aQ61189 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clns1aQ61189 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms