Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irf9Q61179 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Irf9Q61179 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf9Q61179 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms