Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

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Length 930 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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Trpc6Q61143 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc6Q61143 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc6Q61143 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc6Q61143 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc6Q61143 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc6Q61143 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc6Q61143 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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Trpc6Q61143 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc6Q61143 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc6Q61143 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc6Q61143 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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Trpc6Q61143 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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Trpc6Q61143 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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Trpc6Q61143 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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Trpc6Q61143 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc6Q61143 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trpc6Q61143 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc6Q61143 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc6Q61143 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc6Q61143 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc6Q61143 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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Trpc6Q61143 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc6Q61143 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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Trpc6Q61143 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trpc6Q61143 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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Trpc6Q61143 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Trpc6Q61143 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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Trpc6Q61143 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trpc6Q61143 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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Trpc6Q61143 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Trpc6Q61143 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Trpc6Q61143 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc6Q61143 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc6Q61143 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc6Q61143 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc6Q61143 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trpc6Q61143 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc6Q61143 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc6Q61143 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc6Q61143 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc6Q61143 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc6Q61143 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Trpc6Q61143 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc6Q61143 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc6Q61143 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc6Q61143 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc6Q61143 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc6Q61143 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc6Q61143 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trpc6Q61143 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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