Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd3Q61060 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd3Q61060 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd3Q61060 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd3Q61060 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd3Q61060 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd3Q61060 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd3Q61060 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd3Q61060 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd3Q61060 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd3Q61060 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Foxd3Q61060 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Foxd3Q61060 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Foxd3Q61060 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxd3Q61060 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms