Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Neurod1Q60867 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Neurod1Q60867 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Neurod1Q60867 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Neurod1Q60867 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Neurod1Q60867 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Neurod1Q60867 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Neurod1Q60867 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms