Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfrsf8Q60846 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tnfrsf8Q60846 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms