Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cnot7Q60809 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnot7Q60809 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms