Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Klf4Q60793 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf4Q60793 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms