Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atf3Q60765 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atf3Q60765 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Atf3Q60765 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms