Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epha1Q60750 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Epha1Q60750 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms