Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr2f1Q60632 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr2f1Q60632 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms