Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Slc5a6Q5U4D8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc5a6Q5U4D8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms